Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r58G3X9U3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms