Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9a3G3X939 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc9a3G3X939 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms