Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna9G3X8Z7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna9G3X8Z7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms