Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XntrpcF8VQM8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XntrpcF8VQM8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms