Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm16519F8VQK7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms