Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Srp72F8VQC1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp72F8VQC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp72F8VQC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms