Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LctF8VPT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LctF8VPT3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LctF8VPT3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms