Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17654F7AXR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17654F7AXR3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms