Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh11xF6ZNL5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh11xF6ZNL5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.1 ms