Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms