Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl17F6R5P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl17F6R5P4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms