Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Herc6F2Z461 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Herc6F2Z461 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms