Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf165E9QAU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf165E9QAU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf165E9QAU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms