Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmod3E9QA62 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod3E9QA62 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod3E9QA62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms