Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16f1E9Q9P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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