Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrdnE9Q9K5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrdnE9Q9K5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrdnE9Q9K5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms