Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ankrd35E9Q9D8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd35E9Q9D8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms