Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1iE9Q7P2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1iE9Q7P2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1iE9Q7P2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms