Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtproE9Q612 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms