Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ythdc1E9Q5K9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdc1E9Q5K9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdc1E9Q5K9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms