Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BC005561E9Q5E2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BC005561E9Q5E2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BC005561E9Q5E2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 315.3 ms