Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L7

Gm20715, Predicted gene 20715, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20715E9Q3L7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20715E9Q3L7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20715E9Q3L7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20715E9Q3L7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms