Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh3b2E9Q3E1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh3b2E9Q3E1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms