Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NebE9Q1W3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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