Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Myo5cE9Q1F5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Myo5cE9Q1F5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Myo5cE9Q1F5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms