Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdr1E9Q0B4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdr1E9Q0B4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms