Protein–RNA interactions for Protein: E9PZF0

Gm20390, Nucleoside diphosphate kinase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20390E9PZF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20390E9PZF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms