Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcom1E9PZ54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcom1E9PZ54 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcom1E9PZ54 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms