Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ift140E9PY46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ift140E9PY46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ift140E9PY46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ift140E9PY46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ift140E9PY46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms