Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30dE9PWL0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30dE9PWL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30dE9PWL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms