Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc175E9PVB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc175E9PVB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms