Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim5E9PV98 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim5E9PV98 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim5E9PV98 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim5E9PV98 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms