Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
4930407I10RikD3Z5T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
4930407I10RikD3Z5T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
4930407I10RikD3Z5T8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms