Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930467E23RikD3Z1P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
4930467E23RikD3Z1P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930467E23RikD3Z1P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms