Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BC048679D3YXE9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms