Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx8D3YU81 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx8D3YU81 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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