Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cttnbp2B9EJA2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cttnbp2B9EJA2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cttnbp2B9EJA2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cttnbp2B9EJA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cttnbp2B9EJA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cttnbp2B9EJA2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms