Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia1B2RXQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia1B2RXQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfia1B2RXQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfia1B2RXQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfia1B2RXQ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfia1B2RXQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms