Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cspp1B2RX88 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cspp1B2RX88 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cspp1B2RX88 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms