Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cped1B2RX70 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cped1B2RX70 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cped1B2RX70 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms