Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah3B2RWG3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah3B2RWG3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Siah3B2RWG3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms