Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700018F24RikB2RW27 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700018F24RikB2RW27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
1700018F24RikB2RW27 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700018F24RikB2RW27 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms