Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clrn2B2RVW2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms