Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rd3lB2RV38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms