Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Abcc8B2RUS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Abcc8B2RUS7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Abcc8B2RUS7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Abcc8B2RUS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Abcc8B2RUS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms