Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf2B2RT44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lonrf2B2RT44 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf2B2RT44 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms