Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a6B1AVK5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a6B1AVK5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms