Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spocd1B1ASB6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spocd1B1ASB6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms