Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn8B1ARD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn8B1ARD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms