Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem238A9JSM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem238A9JSM3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms